El Prosperando en la escuela contribuye al desarrollo integral de niños, niñas y adolescentes en edad escolar a través de iniciativas de fortalecimiento pedagógico, seguridad alimentaria, salud escolar, promoción de los derechos de la niñez, sostenibilidad ambiental, cultura de paz, mejoramiento de infraestructura y becas. El programa llega a más de 3.200 niños de 4 a 15 años en 28 centros educativos públicos de comunidades rurales con altos índices de pobreza. El programa busca que ninguna causa impida que ningún niño asista a la escuela.